EU-OPENSCREEN化合物处理自动化以及高通量筛选
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EU-OPENSCREEN化合物处理自动化以及高通量筛选
EU-OPENSCREEN的化合物存储和管理系统可以储存并向不同地方的合作伙伴站点提供化合物样本。该系统是一个由13台仪器组成的自动化整合系统,其中包括一台Hamilton Verso®化合物管理设备和两台Hamilton Microlab®STAR(let)液体处理工作站。整个系统由Hamilton VENUS®软件控制,HMotion机械臂可实现设备间的运输。在本案例中,我们将介绍如何使用该系统为EU-OPENSCREEN合作研究机构的高通量筛选(HTS)研究分装超过150万份化合物。
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关于EU-OPENSCREEN
EU-OPENSCREEN是一个成立于2018年的非营利性的欧洲研究基础设施联盟(ERIC),致力于化学生物学和早期药物发现。该联盟为化学工具开发项目的各个阶段提供支持,包括实验、高通量筛选以及对“先导”化合物进行化学优化。此外,它还运营着一个独特的开放式数据库和一个包含10万多种常见化合物的化合物库。EU-OPENSCREEN总监Philip Gribbon博士评论道:“EU-OPENSCREEN致力于提高欧洲在科学研究和经济发展方面的全球地位。我们的服务可提供关键数据,帮助识别和剔除筛选过程中的假阳性结果,从而筛选出有潜力的化合物进行进一步改进。这一过程可确保筛选的结果是可靠、一致和可比较的,从而有助于建立早期药物发现和临床前研究的高标准。”作为一家致力于推进欧洲研究和药物开发的组织,EU-OPENSCREEN作为一个分布式研究基础设施运营,目前在欧洲拥有30多个合作伙伴站点。
EU-OPENSCREEN的化合物管理
EU-OPENSCREEN化合物储存和管理设施位于德国柏林布赫总部,目前有16名员工。该设施负责向所有合作伙伴站点供应化合物。EU-OPENSCREEN化合物管理负责人David Garcia Lopez评论说:“我们的主要工作是维护化合物库,并以高通量方式(如384孔板和1536孔板)向筛选机构提供化合物库。这项工作需要广泛的自动化,以实现极高的通量,同时确保化合物的稳定性和可追溯性。”
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化合物管理自动化
为满足欧盟OPENSCREEN化合物管理设施对通量、灵活性和可靠性的要求,设计并实施了一个高度整合的自动化系统。EU-OPENSCREEN前化合物管理主管Edgar Specker博士评论道:“鉴于化合物管理涉及诸多任务,如储存、开/关盖、板密封/剥离和液体转移,我们一直在寻找能够轻松整合多种设备的自动化解决方案。此外,我们正在寻找声誉卓著的供应商,他们能够为我们提供所需的支持。Hamilton成为了我们理想的合作伙伴。”
系统概述
用于化合物处理的自动化系统包括Hamilton Verso®M2化合物管理系统,该系统通过HMotion机械臂整合Hamilton Microlab®STAR和Microlab®STARlet液体处理工作站,LabElite®开关盖机,离心机,LiCONiC LPX880板存储等设备。一共有13台设备整合到自动化系统中。负责该项目的Hamilton自动化国际项目负责人Karim Benyaa先生解释了这些仪器之间的通信方式:“过去十五年来,Hamilton在整合第三方设备和开发复杂的自动化工作流程方面积累了丰富的经验。我们还与合作伙伴一起制定了一项沟通战略,以便将我们的移液工作站轻松整合到其他复杂的系统中。就EU-OPENSCREEN而言,控制整个工艺流程的最大、最复杂的仪器就是Hamilton系统。其主要优势之一是Hamilton移液工作站VENUS®软件与Hamilton自动样品管理软件INSTINCT®之间的直接通信。为了整合所有第三方设备,我们开发了专用的驱动程序,并将其集成到Hamilton VENUS®软件中,作为中央枢纽发挥作用"。
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自动化方法描述
目前,系统中集成了十个自动化程序,每个程序都使用不同的仪器组合:
1.化合物溶解和分装
2.将化合物放置-20°C的储存中或从中取出
3.96管架到384孔板化合物重排
4.板分装
5.板复制
6.随机挑孔
7.液体转移质量控制
8.LC-MS样本制备
9.梯度稀释
10.384孔板向1536孔板化合物重排
自动化的优势
通量
开发该自动化系统的目的是向所有筛查机构提供EU-OPENSCREEN总部的化合物样本(超过100,000种化合物)。Lopez先生评论道:“自动化取得了成功。在一年半内,我们向我们的合作伙伴供应了150多万份化合物样本,每份化合物库约300块板。如果没有这套自动化系统,我们根本无法实现这一目标。此外,得益于我们的自动化存储系统,我们能够安全地存储、跟踪和取出我们的化合物,而这一切只需很少的人工干预。
灵活性和可整合性
除了将化合物从96管架重排为384孔板的程序外,还在同一集成系统内开发了其他9个程序。这种灵活性在很大程度上归功于通过Hamilton VENUS®软件操作大多数仪器的能力。Specker博士评论道:“整合所有的设备是我们从一开始就确定的一项挑战,而Hamilton为我们提供可靠解决方案的能力是我们选择他们作为供应商的决定性因素。Hamilton团队为我们提供了非常全面的系统概念,并在整个实施阶段一直与我们同行,尽管当时正值COVID-19时期,还有许多不断变化的规定和不确定因素。此外,能够将大型自动化样品管理系统与自动化生态系统的其他部分整合在一起,也是一个独特的提议"。
样本可追溯性
整合系统的主要优势之一是,样本始终可在工作流程中进行追踪。Benyaa先生评论道:“Verso®、开盖机和STAR工作站都能读取样品的条形码,从而实现了可靠的操作。此外,我们在VENUS®软件中添加了一个功能,可以在移液后自动更新化合物瓶中的剩余体积。这有助于以后使用96头进行液体转移,因为Microlab®STAR™确切地知道96管架管中的最低液位,并从这个高度开始吸液。这可以防止移液错误和移液量不正确。”
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