让真正有价值的创新崭露头角!首届上海国际计算生物学创新大赛收官
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让真正有价值的创新崭露头角!首届上海国际计算生物学创新大赛收官
以科技创新驱动产业创新是新质生产力赋能战略性新兴产业的重要路径,实现的关键在于人才。9月9日,历时9个多月的首届上海国际计算生物学创新大赛在2024浦江创新论坛——上海国际计算生物学创新专题论坛上宣布正式收官并举行颁奖仪式。
在现场举行的决赛中,5支团队上演“巅峰对决”。结合湿实验得分(占70%)、决赛现场答辩汇报质量、建模探索过程、建模方案创新性等维度的综合打分,最终评选出一等奖1名、二等奖2名、三等奖2名。其中,一等奖获得者为GeminiMol团队,来自上海科技大学。专家评价:该团队筛选出来的分子经湿实验验证活性最强,具有极大的开发价值。
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以赛选项,让真正有价值的创新崭露头角
去年5月,上海市科委印发《上海市计算生物学创新发展行动计划(2023-2025年)》(以下简称:《计划》),旨在推动计算生物学发展,并赋能解决关键科学研究问题、药物研发和重大疾病防诊治难题。
《计划》通过设立专项支持、建设创新平台体系、衔接产业发展,加强人才引育等措施,围绕算法开发、模型构建、AI药物设计等基础研究与应用基础研究进行系统布局,计划到2025年,建立基于建模、预测、应用全链条的计算生物学研究范式,初步建成生物大数据平台等基础设施,培养、引进一批计算生物学人才,在多模态数据理论算法、蛋白质工程、AI药物研发等领域率先实现重大理论突破,开发出一批具有自主知识产权和国际影响力的算法模型和软件,加速催生一批面向生命健康的颠覆性技术,产出一批可有效规模化应用的新工具、新标准与新产品,为形成计算生物学领域的优势学科,把上海打造成计算生物学领域创新思想、科研范式和重大应用的策源地奠定基础。
作为衔接产业发展的重要举措,在上海市科委的大力支持下,由上海市生物医药科技产业促进中心主办的2023上海国际计算生物学创新大赛于去年12月正式发起。
记者了解到,本届大赛关注的蛋白靶标是NMDA(N-methyl-Daspartate,N-甲基-D-天冬氨酸)受体。
NMDA受体与多种疾病相关,如脑卒中、抑郁症、癫痫、阿尔兹海默症、疼痛等,是神经系统疾病最热门的药物开发靶点之一,靶向NMDA受体的药物开发具有重要的临床意义和治疗市场。GluN1/GluN3A是NMDA受体亚型之一,尚未作为靶点广泛开发,且缺乏晶体结构信息,极大阻碍了靶向GluN1/GluN3A的药物研究进展。
大赛基于NMDA受体家族已知的蛋白序列、结构及活性分子信息,通过AI计算方法发现潜在的特异性作用于GluN1/GluN3A受体的高活性分子。结合湿实验验证,为进一步的药物研发奠定重要基础,并使真正有价值且表现稳健的AI算法崭露头角,推进AI药物研发。
以赛选人,探索人才筛选新机制
据主办方介绍,本届大赛坚持“以赛选人、以赛选项”,获奖者除了获取奖金外,符合条件的团队,将直接纳入上海市科委科技创新行动计划“计算生物学”专项进行后续支持。大赛自上线以来,吸引了一批AI极客的关注,共有1329人(342支团队)报名。
按照大赛规则,最终筛选出86支团队入围初赛,共1023个分子开展湿实验测试,其中,高校团队60支,约占7成,上海团队28支,约占3成。进入前十名的团队中,2支来自上海,其余团队来自包括北京、天津、山东、湖南、辽宁、湖北、江苏、四川等地。
值得关注的是,入围团队名称也别具新意,有“发际线与我们作战”“少不入川”“AI for Drug”等,在实验过程中,科创人才表现出敢于创新、敢于挑战的科学家精神,新一代科创力量也成为了催生未来新质生产力的活力源泉。
本次大赛由上海市生物医药科技产业促进中心主办,中国科学院上海药物研究所原创新药研究全国重点实验室、中国银行上海市分行、华为云计算技术有限公司、临港实验室、上海人工智能研究院、东方美谷企业集团股份有限公司、上海大宁资产经营(集团)有限公司联合主办。
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